Вот это конечно странно. Единственное что можно попробовать, заводить мотор с ушами для охлаждения, дабы исключить попадание воды в цилиндры из системы охлаждения.
Из механических проблем в данном случае возможна только рассинхронизация. Убедится в этом можно сравнив осфилл дпкв и дф на двух моторах один из которых заведомо рабочий.
Для какой наглядности, это основные метки! От меток на звездах до маркированных звеньев просто зубья посчитайте, я понимаю что они не попадают на каждом обороте, Мануал есть по установке фаз?
Еще предложение, покрутите мотор не стартером, чем угодно, шнурком, можно дрелью за гайку маховика. Естественно замок в положение вкл и крутим, смотрим искру и что на форсунках.