У меня Прогресс 3М

[patriot 3163]

на лодке есть вот таких две проблемки,как и чем обработать

а можно верхнюю полку полку вообще срезать по всей длине с двух сторон?

 

[Евгений 28]

Можно выпилить именно это место болгарочкой, в форме овала, не разрезая край углобульба. На получившееся отверстие наложить заплатку и забыть.

 

[shalagin]

а можно верхнюю полку вообще срезать по всей длине с двух сторон?

Это не "полка", а бортовой брызгоотбойник, и одновременно силовой элемент корпуса. Проблемное место надо зашкурить до появления металлического блеска, и покрасить.