Налог начисляется на зарегистрированное судно и мотор. В твоем случае, мотор регистрировать нет необходимости, поэтому налог будет начисляться на судно в размере 1 т.р. в год.
Регистрировать судно нужно, если суммарная масса лодки и максимально возможного мотора для этого судна более 200 кг.